Er zijn een groot deel van de instellingen voor hoger onderwijs in Kirgizië. Dit omvat ongeveer zevenendertig openbare universiteiten en achttien particuliere universiteiten. Prominente universiteiten in Kirgizië zijn Universiteit van Centraal-Azië en Kirgizische National University.

Online voorbereidend jaar cursussen worden aangeboden door een groot aantal hogescholen en universiteiten. Dit biedt studenten de mogelijkheid om post-secundair cursussen in hun eigen tempo. Dit kan vooral gunstig zijn voor studenten op zoek naar een niet-traditionele educatieve ervaring.